2016年底，彭水县有各级各类医疗卫生机构（含村卫生室）476个，其中，医院10个，乡镇卫生院36个，社区卫生服务中心4个，诊所（卫生所、医务室）40个，村卫生室382个，疾病预防控制中心1个，卫生监督所1个，妇幼保健院1个，结核病防治所1个。各类医疗卫生机构开放病床2401张，其中：医院开放病床1171张，乡镇卫生院、社区卫生服务中心开放床位1194张，妇幼保健院开放病床30张。全县有卫生技术人员2340人，其中：执业（助理）医师996人。
2019年8月，入选为紧密型县域医共体建设试点县。
